2010年以来，按照教育部关于“对口支援西部地区高等学校计划”的相关部署，中国农业大学作为组长单位，与浙江大学、华中农业大学、北京化工大学、东华大学、吉林大学、西北农林科技大学、陕西师范大学、南京农业大学和西安电子科技大学10所高校共同开展团队式对口支援塔里木大学工作，并先后与西藏农牧大学、甘肃农业大学、西昌学院明确对口支援关系。

2018年，按照教育部部省合建工作安排，学校开始与河北大学、石河子大学、贵州大学、海南大学4所部省合建高校确立对口合作关系。

2024年7月，为贯彻落实教育部关于对口帮扶工作相关部署，学校与山东农业大学正式建立对口帮扶关系。

多年来，学校秉持高度的政治责任感，贯彻落实中央援疆援藏工作精神和推动中西部高等教育高质量发展的重要战略举措，以人才帮扶为突破口，推动学科精准对接，大力提升受援高校、合建、帮扶高校的人才培养、科学研究和社会服务能力，广泛开展交流与合作，积极推动共建、共享、共赢，有效助力9所高校综合实力以及服务区域经济社会发展能力提升。